二世见赵高没有擅自做主提审已在天牢的李斯，心想这般不管不问也非长久之计，于是便向赵高说道，左丞相李斯涉嫌图谋不轨之罪，此乃朝中大事，朕要找个侦办过此类罪案的御史与爱卿一道办差，待朕想好之后，过两日会让御史专程去往天牢讯问李斯。
赵高一看二世这般安排，心里已是有些慌张，看来二世对李斯涉嫌图谋不轨，还是有些不太相信，而且特意安排御史与自己一道侦办此案，明显是对自己一人侦办李斯图谋不轨之罪，有些不太放心。
赵高一想到二世心疑李斯之罪，不禁哑然失笑，幸亏自己早有应对之策，要不然二世派出御史前去天牢讯问李斯，李斯死不签字供认，还真不好给李斯定罪。
赵高找来一名信得过的手下，让其穿上内宫近侍的官服，前往天牢，说是奉二世指派，前来问询李斯图谋不轨之事。李斯一看二世果然派来内宫近侍过问自己含冤之事，连忙举证自己从未与先皇夫人嫔妃及诸位公子没有往来，也从未与朝中群臣有过私相教受，更是从未有过欺瞒哄骗二世之事。
赵高一边看着手下拿来的李斯书写的自证书简，一边审视着李斯书简中的破绽之处。赵高让手下拿着李斯亲自书写的自证书简，当面质问李斯书简中的破绽。先皇夫人嫔妃及诸位公子皆已奉召自尽，死无对证，李斯再是书写清白之词，此刻也是百口莫辩，赵高手下更是按照赵高交代，借着李斯书简中的死无对证之事，对着李斯就是一顿拳打脚踢。
这赵高手下也是按赵高私下吩咐，只对着李斯腰腹胸背动手，不打脸面，而且殴打之后，就给李斯换上新衣服，让人看不出李斯被人殴打过。李斯已是年逾古稀之人，几次三番之后，李斯已是被打得神智失常，一见来人询问图谋不轨之事，就吓得失禁当场，不等来人细细询问，就连忙亲口承认自己却有图谋不轨之事。
没过几日，二世派出的御史前来天牢提审李斯，御史才是问起李斯有何图谋不轨之事，李斯不等御史细细询问过往之事，就连声说道是自己私下与先皇夫人嫔妃及诸位公子相交，撺掇群臣拦阻陛下。御史初始也是不敢相信李斯之言，再三确认之后，这才拿着李斯亲口说出的口供书简回去复命。
二世接到御史奏报，一脸不可置信，看着手中的李斯亲笔签名的口供书简，略带嘲讽地对着赵高说道，朕是何等信赖李斯，李斯焉能做出如此悖逆之事。二世气愤至极，让赵高依秦律，严惩李斯。赵高见二世已对李斯恨之入骨，便给李斯定了腰斩之刑。
李斯腰斩之后，赵然特意赶到赵高家中，还未落座就急急问道，兄长，李斯被处腰斩之刑，真是陛下亲口应允。赵高淡然说道，那还能有假，以李斯之职，非陛下亲颁王命，何人敢处李斯腰斩之刑。